準(zhǔn)確預(yù)測(cè)植物根系有機(jī)污染物的累積量,機(jī)器學(xué)習(xí)模型做到了!
原標(biāo)題:準(zhǔn)確預(yù)測(cè)植物根系有機(jī)污染物的累積量,機(jī)器學(xué)習(xí)模型做到了!
工人日?qǐng)?bào)-中工網(wǎng)記者 黃哲雯
近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所農(nóng)藥應(yīng)用風(fēng)險(xiǎn)控制創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)首次利用機(jī)器學(xué)習(xí)模型直接預(yù)測(cè)植物根部從土壤中吸收累積農(nóng)藥等有機(jī)污染物的量,解決了傳統(tǒng)線性模型無(wú)法模擬農(nóng)藥被植物吸收的非線性關(guān)系,并揭示了影響植物累積農(nóng)藥的關(guān)鍵化學(xué)分子結(jié)構(gòu),為農(nóng)產(chǎn)品在產(chǎn)地環(huán)境化學(xué)污染的預(yù)測(cè)提供了新的工具和手段。
據(jù)介紹,農(nóng)作物累積是農(nóng)業(yè)污染物從土壤進(jìn)入人類(lèi)食物鏈的重要途徑。準(zhǔn)確預(yù)測(cè)植物吸收和累積農(nóng)業(yè)污染物對(duì)保障食品安全、產(chǎn)地修復(fù)和人類(lèi)健康暴露評(píng)估具有重要的意義。然而,由于污染物-土壤-植物根系之間復(fù)雜的相互作用,建立穩(wěn)健可靠的預(yù)測(cè)模型仍然具有很大挑戰(zhàn)性。
傳統(tǒng)的線性預(yù)測(cè)模型難以預(yù)測(cè)污染物-土壤-植物間的非線性關(guān)系,導(dǎo)致預(yù)測(cè)值與實(shí)際值差異較大。為此,該團(tuán)隊(duì)對(duì)比了四種不同的機(jī)器學(xué)習(xí)算法,通過(guò)對(duì)341個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)、72個(gè)化合物的數(shù)據(jù)集進(jìn)行訓(xùn)練,預(yù)測(cè)植物根系富集值,證明了新構(gòu)建的GBRT-ECFP為最優(yōu)預(yù)測(cè)模型,并通過(guò)5倍交叉驗(yàn)證評(píng)估了預(yù)測(cè)性能,其中R2值為0.77,平均絕對(duì)誤差(MAE)為0.22。
此外,該研究解析了化學(xué)分子、土壤與植物特性之間的非線性關(guān)系。子結(jié)構(gòu)重要性分析明確了分子子結(jié)構(gòu)與植物富集之間的關(guān)系,確定了含氧基團(tuán)(−O)、含氯基團(tuán)(−Cl)、芳環(huán)和大共軛π系統(tǒng)等為與植物累積相關(guān)的關(guān)鍵化學(xué)子結(jié)構(gòu)。
該研究成功利用機(jī)器學(xué)習(xí)作為新興手段預(yù)測(cè)農(nóng)田作物對(duì)農(nóng)藥等污染物的吸收累積,展現(xiàn)了預(yù)測(cè)工具的先進(jìn)性和通用性,為未來(lái)新農(nóng)藥植物吸收潛能評(píng)估和農(nóng)田農(nóng)藥污染安全評(píng)價(jià)提供新的可靠工具。
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